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To recognize and react against unknown proteins, B and T lymphocytes express unique, randomly generated receptors capable of evolving to refine their specificity. These receptors form the immune repertoire, a dynamic and highly diverse library, specific to each individual. The sequencing of these genes now makes it possible to map this repertoire, which provides information both on the individual's immunological history and on their future response capabilities.
Mais l’analyse du répertoire reste un défi majeur : chaque être humain possède 10^{11} récepteurs uniques, dont une majorité qui lui sont exclusifs. Surtout, les interactions entre ces récepteurs et leurs antigènes cibles sont complexes avec les outils actuels. De fait, l’immense majorité des couples anticorps-antigènes sont inconnus, une véritable « matière noire » immunologique, que notre équipe s’attache à éclaircir en combinant méthodes expérimentales et computationnelles.
Experimental methods for measuring interactions : Notre équipe développe des technologies haut débit, alliant séquençage et biologie moléculaire, pour quantifier les affinités entre des milliers d’anticorps et leurs cibles potentielles. Ces approches permettent d’identifier les antigènes reconnus, de découvrir des anticorps d’intérêt thérapeutique ou diagnostique, et d’étudier la maturation d’affinité, l’évolution des anticorps.
Computational models to decipher the repertoire In parallel, we design statistical models to analyze the diversity of repertoires, predict the receptors active against a given target, and simulate their evolution. By integrating experimental data and theories from physics and population genetics, we seek to understand the rules of immune recognition and generate virtual repertoires to test hypotheses.
