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About

Pierre Milpied est Directeur du CIML et Directeur de Recherche (DR2) à l’Inserm. Diplômé de l’École Polytechnique (2007) et titulaire d’un doctorat en immunologie de l’Université Paris-Sud (2010) puis d’une Habilitation à Diriger des Recherches d’Aix Marseille Université (2022), il a effectué son doctorat sous la direction du Pr. Olivier Hermine à l’Hôpital Necker – Enfants Malades (Paris). Après un postdoctorat au Scripps Research Institute en Californie (2011-2014), il a rejoint le CIML où il est devenu chef d’équipe en 2018, responsable scientifique de deux plateformes en 2019, puis Directeur Adjoint en 2024 avant d’accéder à la direction de l’institut. Lauréat du programme “Cadre à Haut Potentiel de l’Inserm” (2023-2024), il a développé des compétences managériales essentielles à la direction d’unités de recherche d’excellence.

Pierre Milpied est fasciné par les processus d’évolution moléculaire et cellulaire des lymphocytes B qui ont lieu dans les centres germinatifs. Ses recherches portent sur l’immunologie intégrative des lymphocytes B, combinant approches de génomique sur cellule unique et analyses bioinformatiques pour étudier les réponses immunitaires en conditions physiologiques et pathologiques. Auteur de plus de 30 publications dans des revues de premier plan, il a développé des méthodes innovantes pour l’analyse intégrée du transcriptome et du répertoire des récepteurs antigéniques. Ses projets de recherche ont été soutenus par de nombreux financements, totalisant plus de 4,2 millions d’euros en tant qu’investigateur principal.

Au sein du CIML, Pierre Milpied dirige l’institut en collaboration avec l’équipe de direction composée de la directrice administrative et financière et du directeur adjoint. Il exerce également les rôles stratégiques de responsable scientifique de la plateforme de Génomique et de la plateforme “Computational Biology, Biostatistics and Modeling” (CB2M) depuis 2019.

Pierre Milpied assume aussi de nombreuses responsabilités dans l’écosystème scientifique national et international. Vice-Président de la Commission Scientifique Nationale CN1 de la Fondation ARC depuis 2024, membre de CENTURI et co-organisateur de ses écoles d’été, il évalue régulièrement des projets pour l’ANR, l’ERC et diverses agences internationales. Reviewer pour de prestigieuses revues scientifiques, il contribue activement au rayonnement et à l’évaluation de la recherche en immunologie, notamment à travers ses nombreuses conférences invitées internationales.

Projects

Project
2025
DECrypting of the Tissue Instruction of Plasmacytoid Dendritic Cells in Homeostasis and Viral Infections (DECITIP)

Project: DECITIP Plasmacytoid dendritic cells (pDCs) excel in the production of type I and III interferons (IFN), […]

Elena TOMASELLO
Pierre MILPIED
Project
2025
Validation, adaptation and development in clinical routine of a single-cell biomarker stratifying high-risk FL patients

Patients with follicular lymphoma (FL) present a very high biological heterogeneity, which strongly impacts the response to current therapies. […]

Sandrine ROULLAND
Project
2025
LYMPHOMATLAS: an atlas of B-cell lymphomas at the single-cell level

Project: LYMPHOMATLAS Single-cell multi-omic studies in B-lymphomas have highlighted a […]

Sandrine ROULLAND
Pierre MILPIED
Project
2025
The RHU PIONeeR project: Precision Immuno-Oncology for patients with advanced non-small cell lung cancer and resistance to PD-(L)1 ICIs

Project: PIONeeR Lung cancer is the leading cause of cancer death, with more than 1.5 million […]

Eric VIVIER
Pierre MILPIED
Project
2025
ANTIBAX: Neutralizing antibodies directed against pro-carcinogenic bacteria

The ANTIBAX project, funded by the France 2030 “Health Impact” program, aims to develop therapeutic antibodies targeting bacteria […]

Pierre MILPIED
Project
2025
TCELL-CODE: Deciphering T cell activation through TCR stimulation dynamics

The TCELL-CODE project, coordinated by Dr. Rémy Lasserre at the Marseille Cancer Research Center, aims to elucidate […]

Pierre MILPIED
Guillaume VOISINNE
Project
2025
PLAIR: Deciphering the hepatic immune response in autoimmune diseases

The PLAIR project, coordinated by Dr Amédée Renand (CR2TI, Nantes), aims to identify the molecular pathways controlling the response […]

Pierre MILPIED
Project
2025
Spatial Omics Lymphomas: Multi-dimensional spatial analysis platform for lymphomas

The structuring action Spatial Omics of the CALYM consortium, coordinated by Dr Pierre Milpied, aims to develop a virtual platform dedicated […]

Pierre MILPIED
Project
2025
LUCA-pi: Immunogenomic biomarkers for the prevention and interception of lung cancer

The University Hospital Research (RHU) project LUCA-pi (Lung Cancer prevention and interception), coordinated by Professor David Boulate (AP-HM), aims […]

Pierre MILPIED
Project
2025
GCselection: Redefining the selection criteria for B lymphocytes in germinal centers

The GCselection project, coordinated by Dr. Pierre Milpied (CIML), revisits the mechanisms of antibody maturation in centers […]

Pierre MILPIED
Mauro GAYA
Project
2025
ST-omics: Structuring regional expertise in spatial transcriptomics

The ST-omics structuring action of the Cancéropôle de la Région Sud is co-coordinated by Dr Pierre Milpied (CIML), Prof Emmanuelle […]

Pierre MILPIED
Project
2025
AITLas-Impact: Deciphering the heterogeneity of angioimmunoblastic T-cell lymphomas

The AITLas-Impact project, coordinated by Pierre Milpied (CIML) in collaboration with Professor François Lemonnier (Mondor Institute of Biomedical Research, […]

Pierre MILPIED
Project
2025
CLL-PID: Familial chronic lymphocytic leukemia and immune deficiencies

Dr. Pierre Milpied's team at CIML is participating in a collaborative project coordinated by Dr. Jean-Pierre de Villartay (Institut […]

Pierre MILPIED

Publications

2024
Clemence Ngo, Khalissa Rahmani, Michael Valente, Nils Collinet, Gilles Bessou, Manon Fabregue, Sarah..., Plasmacytoid dendritic cells are dispensable or detrimental in murine systemic or respiratory viral infections, 2024.
2024
Ado S, Dong C, Attaf N, Moussa M, Carrier A, Milpied P, Navarro JM, FB5P-seq-mAbs: monoclonal antibody production from FB5P-seq libraries for integrative single-cell analysis of B cells. Front Immunol 2024; 15(): 1505971.
2023
Aussel R, Asif M, Chenag S, Jaeger S, Milpied P, Spinelli L, ShIVA: a user-friendly and interactive interface giving biologists control over their single-cell RNA-seq data. Sci Rep 2023 Sep; 13(1): 14377.
2022
Gregoire C, Spinelli L, Villazala-Merino S, Gil L, Holgado MP, Moussa M, Dong C, Zarubica A, Fallet ..., Viral infection engenders bona fide and bystander subsets of lung-resident memory B cells through a permissive mechanism. Immunity 2022 Jul; 55(7): 1216-1233.e9.
2021
Crinier A, Dumas PY, Escalière B, Piperoglou C, Gil L, Villacreces A, Vély F, Ivanovic Z, Milpied ..., Fix: Single-cell profiling reveals the trajectories of natural killer cell differentiation in bone marrow and a stress signature induced by acute myeloid leukemia. Cell Mol Immunol 2021 Nov; 18(11): 2578-2580.
2021
Ghislat G, Cheema AS, Baudoin E, Verthuy C, Ballester PJ, Crozat K, Attaf N, Dong C, Milpied P, Mali..., NF-κB-dependent IRF1 activation programs cDC1 dendritic cells to drive antitumor immunity. Sci Immunol 2021 Jul; 6(61): .
2021
Crinier A, Dumas PY, Escalière B, Piperoglou C, Gil L, Villacreces A, Vély F, Ivanovic Z, Milpied ..., Single-cell profiling reveals the trajectories of natural killer cell differentiation in bone marrow and a stress signature induced by acute myeloid leukemia. Cell Mol Immunol 2021 May; 18(5): 1290-1304.
2021
Amé P, Dumortier H, Espéli M, Milpied P, Fazilleau N, The “French Germinal Center Club” of the French Society for Immunology: a dynamic collaboration between researchers passionate about the germinal center reaction. Eur J Immunol 2021 Feb; 51(2): 270-271.
2014
Mendes-da-Cruz DA, Brignier AC, Asnafi V, Baleydier F, Messias CV, Lepelletier Y, Bedjaoui N, Renand..., Semaphorin 3F and neuropilin-2 control the migration of human T-cell precursors. PLoS One 2014; 9(7): e103405.