Camille SOUN

About

Career

J’ai fait une Licence Bidisciplinaire Biologie et Mathématiques appliquées à l’Université de Pierre et Marie Curie (Paris 6), avec une L3 à Manchester (Angleterre), puis un Master de BioImagerie (M1 à Bordeaux et M2 à Lyon, et stage de M2 à Essen, Allemagne).

Ensuite j’ai travaillé 4 ans à l’Universitätsklinikum de Essen (Allemagne), en tant qu’ingénieure d’étude dans l’équipe de Daniel Robert Engel, “Immunodynamics”, où j’ai travaillé sur l’automatisation d’analyses d’images de fluorescence et des données MALDI-MSI. J’ai appliqué ces méthodes à des projets en oncologie humaine (mélanomes, leucémie…) et en biologie murine (rate, vessie, rein, cerveau…).

Depuis, je travaille au CIML, en tant qu’ingénieure d’étude en Bioinformatique dans l’équipe de Sandrine Roulland, Pathogenesis and Targeting of Lymphoid Neoplasms, sur la mise au point et gestion de l’analyse de datasets de données de CRISPR-Cas9 KO Screens. J’ai appliqué ce pipeline à des projets de recherche en hématologie humaine (Lymphome Folliculaire, DLBCL, Myélome multiple…). Je gère également de l’analyse de données Transcriptomiques (Single-Cell RNA-seq), appliquées à un projet de recherche en oncologie murine (Lymphome Folliculaire). J’ai également travaillé sur des jeux de données de transcriptomique spatiale (Visium) et d’ECCITE-Seq.

Expertise

Mon expertise principale est la BioInformatique, appliquée aux jeux de données suivants :

• l’analyse de données CRISPR Screens (Mageck, R, Bash)
• l’analyse de données de transcriptomique (R, Bash)
• l’analyse d’image de Fluorescence (JavaScript, FiJi, R)

Internal cross-functional missions

Je fais partie de la plateforme “CRISPR LabTech”, créée en 2023 et labelisée par INSERM, CNRS et AMU, sur laquelle j’ai participé à l’analyse de données de CRISPR Screens sur plus de 12 projets.

Institutional external missions

Je fais partie, au sein du CIML, de la cellule Ecocitoyens, du Conseil de Laboratoire en tant que représentante des ITA CDD, ainsi que de la Cellule Prévention des Risques Psycho-Sociaux (RPS).