Job: Ingénieur d’études en Immunologie

About

L’objectif principal de l’ingénieur sera d’identifier les cellules ciblées par les interférons de type I (IFN-I) produits par les cellules dendritiques plasmacytoïdes (pDC), puis de disséquer les mécanismes moléculaires sous-jacents favorisant les effets néfastes dans les poumons infectés par la grippe. En particulier, l’ingénieur étudiera l’impact des IFN-I produits par les pDC sur l’immunopathologie pulmonaire, les lésions tissulaires et les troubles respiratoires associés à l’infection grippale. Ces études seront réalisées à l’aide de modèles murins génétiquement modifiés, éventuellement associés à des inhibiteurs pharmacologiques.

1-1) Gérer les colonies de souris mutantes dédiées, incluant le croisement de diverses souches entre elles, le génotypage des animaux par PCR, la gestion des croisements et des stocks en cohérence avec les besoins des chercheurs.

1-2) Réaliser des expériences sous la supervision du Dr Marc Dalod et du Dr Elena Tomasello, en étroite collaboration avec une doctorante, Marine Zaffran, et une assistante ingénieure, Camille Pierini-Malosse, au sein de l’équipe, pour caractériser l’activation spatiotemporelle des pDCs et leurs interactions avec d’autres types cellulaires, in vivo chez la souris, dans les poumons et leur ganglion drainant, en comparant des conditions expérimentales où les pDCs sont présentes et fonctionnelles, totalement absentes, ou présentes mais incapables d’exercer certaines fonctions.

1-3) Réaliser des expériences en collaboration avec d’autres équipes du CIML, notamment : i) l’équipe de Mauro Gaya, expert dans le déchiffrage des mécanismes contrôlant l’activation et la polarisation fonctionnelle des lymphocytes B, y compris localement lors de maladies des voies respiratoires ; ii) l’équipe de Réjane Rua, experte en immunosurveillance du système nerveux central lors d’auto-immunité ou d’infections, et plus généralement dans l’étude des interactions neuro-immunes ; et iii) Cyrille Mionnet, dans l’équipe de Marc Bajenoff, experte dans l’étude des réponses immunitaires mémorielles muqueuses aux infections, en particulier le rôle des cellules T mémorielles résidentes dans les tissus (TRM).

Activités principales :

•             Mettre en œuvre les procédures nécessaires pour assurer le maintien et la surveillance de la santé et du statut génétique des animaux dans le strict respect du cadre juridique et éthique correspondant.

•             Mettre en œuvre les protocoles expérimentaux inclus dans le projet de recherche dans le strict respect des protocoles approuvés par le comité d’éthique dédié et le ministère de la santé, ainsi que des règles 3R, en travaillant dans un confinement NSB3, en se conformant aux règles de fonctionnement de cette installation.

•             Réaliser et interpréter des expériences basées sur la cytométrie en flux multiparamétrique conventionnelle (~15 couleurs) et la cytométrie spectrale à haut contenu (>30 couleurs) afin d’identifier et de caractériser les cellules ciblées par les pDC et leur IFN isolées à partir des poumons d’animaux témoins ou mutants infectés par la grippe, ainsi que de caractériser les réponses des cellules B et T mémoires induites lors de l’infection primaire dans les poumons et les ganglions lymphatiques médiastinaux, et les réponses anamnestiques en réponse à des infections secondaires.

•             Réaliser des expériences de profilage de l’expression génique en vrac et sur des cellules individuelles sur des cellules hématopoïétiques et non hématopoïétiques isolées à partir des poumons d’animaux témoins ou mutants infectés par la grippe.

•             Isoler les poumons et les cerveaux d’animaux témoins ou mutants infectés par la grippe, réaliser l’inclusion des organes pour l’histologie, la préparation des coupes tissulaires et la coloration pour l’analyse par microscopie confocale spectrale.

Activités associées :

•             Participer au fonctionnement du NSB3 (décontamination et recyclage du matériel d’élevage des souris, décontamination et élimination des déchets biologiques, surveillance des stocks d’équipements et de consommables et leur réapprovisionnement).

•             Participer à gérer les commandes de l’équipe, leur réception et les stocks de consommables.

•             Participer aux tâches de préparation de réactifs communs à l’équipe.

•             Participer aux tâches d’entretien des espaces et équipements attribués à l’équipe.Connaissances

Connaissances

•             Exigées: connaissances expertes en expérimentation animale, et plus spécifiquement sur la gestion et l’utilisation de colonies de souris.

•             Exigée: excellente maîtrise de la bureautique (logiciel Pack Office).

•             Exigées: connaissances socles en Immunologie.

•             Exigée: bonne compréhension de l’anglais scientifique écrit et oral.

•             Souhaitée: bonne maîtrise de la langue française.

Savoir-faire

•             Exigé : excellente maîtrise de l’expérimentation animale (niveau applicateur ; capacité avérée à mettre en œuvre les procédures nécessaires pour assurer le maintien et la surveillance de la santé et du statut génétique des animaux, et à concevoir, gérer et réaliser des protocoles expérimentaux adaptés aux questions scientifiques posées et en stricte conformité avec le cadre juridique et éthique correspondant).

•             Exigé : excellente maîtrise de la cytométrie en flux multiparamétrique conventionnelle (~15 couleurs) ou de la cytométrie spectrale (>30 couleurs) (préparation de suspensions cellulaires à partir de poumons et de moelle osseuse ; marquage cellulaire multicolore ; acquisition d’échantillons sur un analyseur cytométrique ; analyse des données à l’aide de logiciels tels que DIVA ou FlowJo).

•             Exigé: excellente maîtrise des techniques de biologie moléculaire, notamment l’extraction d’ADN, l’extraction d’ARN, la quantification et l’analyse qualitative de l’ADN et de l’ARN, la PCR, la RT-qPCR.

Aptitudes

•             Exigées: bonnes aptitudes relationnelles, capacité à travailler en équipe dans un environnement multidisciplinaire.

•             Exigée: capacité à écouter, assimiler et mettre en œuvre les instructions et les conseils.

•             Exigées: excellentes compétences organisationnelles.

•             Exigées: rigueur, fiabilité, sens de l’analyse et de la synthèse.

•             Exigée: présentation orale en anglais de ses propres résultats lors des réunions d’équipe.

•             Souhaitées: capacité à faire des suggestions ; autonomie, confiance en soi, sens de l’initiative.

Spécificités et contraintes du poste

•             Travail en laboratoire confiné NSB3, avec suivi médical renforcé.

•             Travail ponctuel en horaire décalé et/ou prolongé, (tôt le matin et/ou tard le soir).

•             Manipulation de toxine diphtérique.

Expérience souhaitée

•             Travail dans une installation NSB3 pour la manipulation d’animaux infectés, avec

•             Expérience pratique positive dans la génération de bout en bout de bibliothèques de séquençage d’ARNm en vrac et/ou de cellules uniques (préparation de plaques à 96 puits pour la récupération de cellules uniques triées une par puits ; conception d’une stratégie de tri des plaques à l’aide de la cytométrie en flux multiparamétrique conventionnelle ; synthèse d’ADNc ; amplification, purification, quantification et contrôle qualité ; production de bibliothèques ; quantification, contrôle qualité et pool de bibliothèques ; génération du fichier de métadonnées requis pour la conception et l’analyse du séquençage).

Diplôme souhaité : M2 en Immunologie, Biologie cellulaire, Biologie Moléculaire, ou disciplines connexes

Type de contrat: CDD d’1 an, avec possibilité éventuelle de prolongation.

Rémunération: environ 2494,30 euros bruts mensuels, adapté selon la durée de l’expérience professionnelle acquise.

Date souhaitée de prise de fonctions: entre le 01/03/2026 et le 01/04/2026, selon les délais nécessaires pour l’établissement du contrat de travail

Modalités de candidature: adresser CV, lettre de motivation et coordonnées de référents à : Elena TOMASELLO et Marc DALOD : tomasell@ciml.univ-mrs.fr And dalod@ciml.univ-mrs.fr, avant le 17/12/2025.