Facility: Crispr Screen Labtech

About

Créée en 2020 à l’initiative du Cancéropôle PACA, la plateforme CRISPR Screen LabTech établie au CIML depuis 2023 apporte une expertise de pointe dans la réalisation de criblages fonctionnels génomiques basés sur la technologie CRISPR-Cas9. Sous la direction scientifique de Sandrine Roulland (Chef d’équipe), alle accompagne les projets de criblage CRISPR aux niveaux local, régional et national. En 2023, la plateforme a obtenu le label « Plateforme Aix-Marseille » pour une durée de trois ans, délivré par l’AMU, l’INSERM et le CNRS.L’équipe opérationnelle rassemble deux ingénieures biologistes, Anaelle Luce And Sophie Guia Da Silva, et une ingénieure en bioinformatique, Camille Soun.

Nos Missions

• Offrir un accompagnement personnalisé dans la conception et la réalisation de criblages CRISPR pangénomiques.
• Soutenir des projets couvrant tous les domaines de la biologie (oncologie, immunologie, infectiologie, neuro-immunologie, immunothérapie…)
• Promouvoir l’utilisation des criblages CRISPR comme outil essentiel pour identifier, de façon non biaisée, des gènes impliqués dans la sensibilité ou la résistance à un stress biologique (médicament, infection virale, etc.)

Prestations proposées

• Conception et mise en place de criblages CRISPR de perte de fonction à l’échelle du génome entier (inactivation CRISPRko, interférence CRISPRi) in vitro sur lignées cellulaires humaines ou murines
• Production des librairies virales pangénomiques
• Génération de lignées cellulaires exprimant la Cas9
• Suivi du processus de criblage et mise au point des protocoles
• Génération des librairies de séquençage CRISPR
• Analyses bioinformatiques préliminaires et identification de gènes candidats

Recherche & Développement

• Criblages CRISPR combinés à l’analyse en cellule unique (PERTURB-seq/ ECCITE-seq)
• Criblages CRISPR inter-cellulaires (co-culture tumeur/cellules effectrices immunes)
• Criblages CRISPR phénotypiques

Open Science