Facility: Histology
About
Fondé en 2005, la plateforme d’histologie du Centre d’Immunologie de Marseille-Luminy (CIML) est un service technologique ouvert aux chercheurs du CIML et à ses partenaires, elle constitue un support indispensable pour la compréhension des mécanismes cellulaires et moléculaires de l’immunité. Elle met à disposition des équipes de recherche un parc complet d’équipement (appareils de coupes, automates ou des lames virtuelles) permettant l’analyse tissulaire de haute qualité pour des projets de recherche fondamentale.
La plateforme bénéficie aujourd’hui d’une expertise reconnue, attestée par plus de 84 publications, dans le domaine de l’histologie expérimentale.
Mission
- Fournir et assurer la maintenance de tout l’équipement nécessaire pour mener à bien la partie histologique d’un projet scientifique.
- Train users grâce à des enseignements théoriques et pratiques
- Fournir une assistance scientifique et technique pour la réalisation de projets scientifiques
- La mise au point et l’optimisation de protocole pour répondre aux besoins spécifiques des projets scientifiques
- Le développement de nouvelles approches, comme l’utilisation de la technologie Visium (10x Genomics) pour la transcriptomique spatiale ou le RNAscope pour la détection d’ARN in situ.
Prestations proposées
La plateforme propose un large panel de services, allant de la préparation des échantillons à l’analyse :
- Préparation, inclusion et coupe d’échantillons
- Paraffine
- Cryosection
- Vibratome
- Coloration standard
- H&E (Hématoxyline-éosine)
- Syrius Red
- PAS
- Trichrome de Masson
- Immunomarquages et hybridation In-situ
- Immunomarquage (IHC) (IHF)
- RNAscope (marquage ARN in situ)
- Analyse et imagerie
- Scanner de lames (lumière blanche et fluorescent)
- Accompagnement à la microscopie confocale (en collaboration avec la plateforme Imagimm)
- Accompagnement scientifique
- Conseils sur les stratégies expérimentales
- Optimisation des protocoles
- Formation utilisateurs
Training
La plateforme d’histologie assure des formations aussi bien au sein du CIML qu’en dehors :
- Organization of training INSERM sur l’imagerie confocale spectrale
- Courses and practical work integrated into the Master of Immunology (Faculté des Sciences de Luminy) et de l’Polytech engineering school
Projects
Project: DECITIP Plasmacytoid dendritic cells (pDCs) excel in the production of type I and III interferons (IFN), […]
Our health depends on a delicate balance between immune defense against pathogens and tolerance to […]
Lymph nodes are formed in the embryo by Lymphoid Tissue Inducer (LTi) cells. LTi cells arise not from the yolk […]
Project: pDCComp Individuals infected with viruses or suffering from inflammatory diseases develop a set of behavioral disorders […]
Project: PLBIO 2024 Coordinator: Thierry Walzer, CIRI, Lyon. Other participant: Nathalie Bendriss-Vermare, CRCL, Lyon. Abstract: Natural Killer cells […]
Project: ACLAMADABREC Partly through their effectiveness in activating natural killer (NK) cells and CD8 T lymphocytes […]
Project: UNFIRE Other participants: Ciphe (Ana Zarubica), Hospices Civils de Lyon and CIRI (Sophie Trouillet-Assant, Thierry Walzer), CoVir team […]
Project: PLBIO-25 Coordinator: Marianne BURBAGE, Institut Curie, Paris. Other participant: Andrew GRIFFITHS, ESPCI, Paris. The effectiveness of CD8 T lymphocytes […]
Project: RIPIREVI Other participants: CIPHE (Ana Zarubica and colleagues). Abstract: Type I interferons (IFN-Is) are essential for […]
Project: ICARO Current acellular vaccines are mostly effective against extracellular pathogens, but fail to induce a response […]
Project: PPTuft This project coordinated by Philippe Jay (IGF, Montpellier) in partnership with our team aims to determine the […]
Project: EndoPos The EndoPos project explores the role of the GDPD2 enzyme, produced in particular by pulp fibroblasts […]
Patients with follicular lymphoma (FL) present a very high biological heterogeneity, which strongly impacts the response to current therapies. […]
Bone marrow metabolic niches regulate hematopoiesis (MetaNiche, ANR-22-CE15-0015-02). Duration: 2023–2027 (42 months).Partners & funding amounts: Institut Curie (L. Perié), Institut […]
Full title & acronym: Understanding lipid immunometabolism to treat disease (UNLIMITED).Duration: 2025–2029 (48 months).Partners & funding amounts: Consortium led by […]
The host response to pathogens is orchestrated by the immune system and the nervous system, both present in […]
We have demonstrated that the neurokine TAFA4, produced by sensory neurons in the skin, can promote tissue repair […]
Beyond the pain perception processes that are induced in the event of injury or infection of the […]
Duration: 2021–2025.Partners & funding amounts: APHM/La Timone (E. Tabouret); amount for team: 325 k€.Responsibilities: PI–coordinator (only beneficiary)Theme & content of […]
The GCselection project, coordinated by Dr. Pierre Milpied (CIML), revisits the mechanisms of antibody maturation in centers […]
Equipments
L’automate Excelsior XT permet une déshydratation des échantillons et un imprégnation des tissus avec de la paraffine liquide. L’histostar permet […]
Le SnapFrost est un automate permettant la congélation très rapide des tissus biologiques, tout en contrôlant la température de congélation […]
Le Leica Autostainer XL (ST5010) est un automate de coloration de lames conçu pour les laboratoires d’anatomopathologie. Polyvalent, il prend en charge différents protocoles de […]
Le PANNORAMIC SCAN II est un scanner numérique de lames histologiques. Ce scanner est capable de créer des lames virtuelles […]
Le vibratome est un appareil dédié à la réalisation de coupes épaisses généralement de tissus mous non inclus en paraffine […]
Microtome HM340E et avec le système STS et un appareil dédié de coupe fine d’échantillon en paraffine. Le système STS […]
Le cryostat CM1950s un appareil dédié à la réalisation de cryosection d’échantillon en série.
Cette appareil permet d’isoler des cellules d’intérêt à partir de coupes de tissus inclus en paraffine ou de tissus congelés […]
Les 2 cryostats CM3050s sont des appareils dédiés à la réalisation de cryosection d’échantillon en série.
Le four HybEZ est un four d’hybridation de paillasse simple. II est capable maintenir avec précision la stabilité de la […]
Microscope à lumière blanche avec caméra pour les analyses de coloration. Permet aussi l’analyse des échantillons avec une lumière polarisée.