Sebastien JAEGER – CIML

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Dorian BOURGEON

À propos

Sébastien Jaeger est ingénieur de recherche hors classe CNRS, coresponsable du CB2M (Computational Biology, Biostatistics & Modelling). De formation initial en physique et en mathématiques appliquées (Doctorat de physique théorique), il a plus de vingt ans d’expérience en biologie computationelle et en immunologie en évoluant à l’interface entre la physique, les mathématiques, et la biologie (plus particulièrement l’immunologie). Ces centres d’intérêt s’orientent vers la modélisation mathématique et la biophysique fondamentale. Issu du domaine des systèmes dynamiques en physique, il s’intéresse tout particulièrement aux phénomènes dynamiques en biologie et explore des systèmes et problématiques immunologiques par des approches formelles.

Carrière

Ingénieur en mécanique énergétique (IUSTI, aujourd’hui devenu Polytech, 1999)

Doctorat de physique théorique (Centre de physique théorique de Marseille, 2002)

Postdoctorat en bioinformatique au Laboratoire de Génétique et Physiologie du Développement (LGPD) puis à l’Institut de Biologie du Développement de Marseille (IBDM)

Ingénieur de recherche au CIML (2005)

Recrutement en tant qu’Ingénieur de recherche statutaire (CNRS) au CIML (2006)

Création en 2009 du CB2M dont il est responsable depuis (coresponsable depuis 2025).

Projets

TCELL-CODE : Décrypter l’activation des lymphocytes T par la dynamique de stimulation du TCR

Le projet TCELL-CODE, coordonné par le Dr Rémy Lasserre au Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille vise à élucider […]

Guillaume VOISINNE

ST-omics : Structurer l’expertise régionale en transcriptomique spatiale

L’action structurante ST-omics du Cancéropôle de la Région Sud est co-coordonnée par le Dr Pierre Milpied (CIML), le Pr Emmanuelle […]

Publications

Aussel R, Asif M, Chenag S, Jaeger S, Milpied P, Spinelli L, ShIVA: a user-friendly and interactive interface giving biologists control over their single-cell RNA-seq data., Sci Rep 2023 Sep; 13(1): 14377.

Crinier A, Milpied P, Escalière B, Piperoglou C, Galluso J, Balsamo A, Spinelli L, Cervera-Marzal I..., High-Dimensional Single-Cell Analysis Identifies Organ-Specific Signatures and Conserved NK Cell Subsets in Humans and Mice., Immunity 2018 Nov; 49(5): 971-986.e5.

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Dalet A, Argüello RJ, Combes A, Spinelli L, Jaeger S, Fallet M, Vu Manh TP, Mendes A, Perego J, Rev..., Protein synthesis inhibition and GADD34 control IFN-β heterogeneous expression in response to dsRNA., EMBO J 2017 Mar; 36(6): 761-782.

Medina-Rivera A, Defrance M, Sand O, Herrmann C, Castro-Mondragon JA, Delerce J, Jaeger S, Blanchet ..., RSAT 2015: Regulatory Sequence Analysis Tools., Nucleic Acids Res 2015 Jul; 43(W1): W50-6.

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