Marie-Claire BLACHE – CIML

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À propos

Ingénieure d’Étude CNRS spécialisée en microscopie, j’exerce depuis janvier 2024 sur la plateforme ImagImm. Ma formation à l’interface entre la biologie et la physique m’a conduite à occuper différents postes dans des instituts de recherche (CIML, IPBS, INRS Canada). En 2014, j’ai intégré le Plateau d’Imagerie Cellulaire de l’INRAE Val de Loire, une expérience qui m’a permis de développer les compétences nécessaires à mon métier actuel.

Mon expertise repose sur la maîtrise des techniques de microscopie photonique (fluorescence, confocale, spectrale, FCS, FRAP), du traitement et de l’analyse d’images (ImageJ, QuPath, Imaris), ainsi que de leur automatisation via des outils classiques et d’intelligence artificielle (Machine Learning et Deep Learning). J’assure également la formation des utilisateurs à l’utilisation des équipements de la plateforme et aux solutions de traitement d’images.

Je suis membre active du GT MAIIA (Groupe de Travail « Méthodes d’analyses d’images par Intelligence Artificielle ») rattaché Réseau Technologique de microscopie de fluorescence multidimensionnelle du CNRS. Ce groupe a pour objectif d’accompagner le personnel des plateformes dans l’utilisation des outils de Machine Learning (ML) et de Deep Learning (DL) pour le traitement et l’analyse d’images.

Publications

Court L, Talbottier L, Lemarchand J, Cornilleau F, Pecnard E, Blache MC, Balthazart J, Cornil CA, Ke..., Exploring neuronal markers and early social environment influence in divergent quail lines selected for social motivation., Sci Rep 2024 Oct; 14(1): 23554.

Graham S, Vu QD, Jahanifar M, Weigert M, Schmidt U, Zhang W, Zhang J, Yang S, Xiang J, Wang X, Rumbe..., CoNIC Challenge: Pushing the frontiers of nuclear detection, segmentation, classification and counting., Med Image Anal 2024 Feb; 92(): 103047.

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Bertin A, Mulot B, Nowak R, Blache MC, Love S, Arnold M, Pinateau A, Arnould C, Lansade L, Captive Blue-and-yellow macaws (Ara ararauna) show facial indicators of positive affect when reunited with their caregiver., Behav Processes 2023 Mar; 206(): 104833.

Chevillard PM, Batailler M, Piégu B, Estienne A, Blache MC, Dubois JP, Pillon D, Vaudin P, Dupont J..., Seasonal vascular plasticity in the mediobasal hypothalamus of the adult ewe., Histochem Cell Biol 2022 May; 157(5): 581-593.

Alcântara-Neto AS, Schmaltz L, Caldas E, Blache MC, Mermillod P, Almiñana C, Porcine oviductal extracellular vesicles interact with gametes and regulate sperm motility and survival., Theriogenology 2020 Oct; 155(): 240-255.

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Ramal-Sanchez M, Bernabo N, Tsikis G, Blache MC, Labas V, Druart X, Mermillod P, Saint-Dizier M, Progesterone induces sperm release from oviductal epithelial cells by modifying sperm proteomics, lipidomics and membrane fluidity., Mol Cell Endocrinol 2020 Mar; 504(): 110723.

Bertin A, Cornilleau F, Lemarchand J, Boissy A, Leterrier C, Nowak R, Calandreau L, Blache MC, Boivi..., Are there facial indicators of positive emotions in birds? A first exploration in Japanese quail., Behav Processes 2018 Dec; 157(): 470-473.

Bertevello PS, Teixeira-Gomes AP, Seyer A, Vitorino Carvalho A, Labas V, Blache MC, Banliat C, Corde..., Lipid Identification and Transcriptional Analysis of Controlling Enzymes in Bovine Ovarian Follicle., Int J Mol Sci 2018 Oct; 19(10): .

Mailfert S, Touvier J, Benyoussef L, Fabre R, Rabaoui A, Blache MC, Hamon Y, Brustlein S, Monneret S..., A Theoretical High-Density Nanoscopy Study Leads to the Design of UNLOC, a Parameter-free Algorithm., Biophys J 2018 Aug; 115(3): 565-576.

Tréfier A, Musnier A, Landomiel F, Bourquard T, Boulo T, Ayoub MA, León K, Bruneau G, Chevalier M,..., G protein-dependent signaling triggers a β-arrestin-scaffolded p70S6K/ rpS6 module that controls 5’TOP mRNA translation., FASEB J 2018 Mar; 32(3): 1154-1169.

Bertin A, Beraud A, Lansade L, Blache MC, Diot A, Mulot B, Arnould C, Facial display and blushing: Means of visual communication in blue-and-yellow macaws (Ara Ararauna)?, PLoS One 2018 ; 13(8): e0201762.

Lamy J, Corbin E, Blache MC, Garanina AS, Uzbekov R, Mermillod P, Saint-Dizier M, Steroid hormones regulate sperm-oviduct interactions in the bovine., Reproduction 2017 Oct; 154(4): 497-508.

Mauroy C, Castagnos P, Orio J, Blache MC, Rico-Lattes I, Teissié J, Rols MP, Blanzat M, Versatile cellular uptake mediated by catanionic vesicles: simultaneous spontaneous membrane fusion and endocytosis., Mol Pharm 2015 Jan; 12(1): 103-10.

Rochette PA, Laliberté M, Bertrand-Grenier A, Houle MA, Blache MC, Légaré F, Pearson A, Visualization of mouse neuronal ganglia infected by Herpes Simplex Virus 1 (HSV-1) using multimodal non-linear optical microscopy., PLoS One 2014 ; 9(8): e105103.

Mauroy C, Portet T, Winterhalder M, Bellard E, Blache MC, Teissié J, Zumbusch A, Rols MP, Giant lipid vesicles under electric field pulses assessed by non invasive imaging., Bioelectrochemistry 2012 Oct; 87(): 253-9.

Mauroy C, Castagnos P, Blache MC, Teissié J, Rico-Lattes I, Rols MP, Blanzat M, Interaction between GUVs and catanionic nanocontainers: new insight into spontaneous membrane fusion., Chem Commun (Camb) 2012 Jul; 48(53): 6648-50.