Plateforme: Histologie
À propos
Fondé en 2005, la plateforme d’histologie du Centre d’Immunologie de Marseille-Luminy (CIML) est un service technologique ouvert aux chercheurs du CIML et à ses partenaires, elle constitue un support indispensable pour la compréhension des mécanismes cellulaires et moléculaires de l’immunité. Elle met à disposition des équipes de recherche un parc complet d’équipement (appareils de coupes, automates ou des lames virtuelles) permettant l’analyse tissulaire de haute qualité pour des projets de recherche fondamentale.
La plateforme bénéficie aujourd’hui d’une expertise reconnue, attestée par plus de 84 publications, dans le domaine de l’histologie expérimentale.
Mission
- Fournir et assurer la maintenance de tout l’équipement nécessaire pour mener à bien la partie histologique d’un projet scientifique.
- Former les utilisateurs grâce à des enseignements théoriques et pratiques
- Fournir une assistance scientifique et technique pour la réalisation de projets scientifiques
- La mise au point et l’optimisation de protocole pour répondre aux besoins spécifiques des projets scientifiques
- Le développement de nouvelles approches, comme l’utilisation de la technologie Visium (10x Genomics) pour la transcriptomique spatiale ou le RNAscope pour la détection d’ARN in situ.
Prestations proposées
La plateforme propose un large panel de services, allant de la préparation des échantillons à l’analyse :
- Préparation, inclusion et coupe d’échantillons
- Paraffine
- Cryosection
- Vibratome
- Coloration standard
- H&E (Hématoxyline-éosine)
- Syrius Red
- PAS
- Trichrome de Masson
- Immunomarquages et hybridation In-situ
- Immunomarquage (IHC) (IHF)
- RNAscope (marquage ARN in situ)
- Analyse et imagerie
- Scanner de lames (lumière blanche et fluorescent)
- Accompagnement à la microscopie confocale (en collaboration avec la plateforme Imagimm)
- Accompagnement scientifique
- Conseils sur les stratégies expérimentales
- Optimisation des protocoles
- Formation utilisateurs
Formation
La plateforme d’histologie assure des formations aussi bien au sein du CIML qu’en dehors :
- Organisation d’une formation INSERM sur l’imagerie confocale spectrale
- Cours et travaux pratiques intégrés au Master d’Immunologie (Faculté des Sciences de Luminy) et de l’école d’ingénieurs Polytech
Projets
Project : DECITIP Les cellules dendritiques plasmacytoides (pDCs) excellent dans la production des interférons de type I et III (IFN), […]
Notre santé repose sur un équilibre délicat entre la défense immunitaire contre les agents pathogènes et la tolérance vis à […]
Lymph nodes are formed in the embryo by Lymphoid Tissue Inducer (LTi) cells. LTi cells arise not from the yolk […]
Project : pDCComp Les individus infectés par des virus ou souffrant de maladies inflammatoires développent un ensemble de troubles comportementaux […]
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Project : RIPIREVI Autres participants: CIPHE (Ana Zarubica et collègues). Résumé: Les interférons de type I (IFN-Is) sont essentiels à […]
Project : ICARO Les vaccins acellulaires actuels sont surtout efficaces contre les pathogènes extracellulaires, mais échouent à induire une réponse […]
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Project : Endopos Le projet EndoPos explore le rôle de l’enzyme GDPD2, produite notamment par les fibroblastes de la pulpe […]
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Équipements
L’automate Excelsior XT permet une déshydratation des échantillons et un imprégnation des tissus avec de la paraffine liquide. L’histostar permet […]
Le SnapFrost est un automate permettant la congélation très rapide des tissus biologiques, tout en contrôlant la température de congélation […]
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Le vibratome est un appareil dédié à la réalisation de coupes épaisses généralement de tissus mous non inclus en paraffine […]
Microtome HM340E et avec le système STS et un appareil dédié de coupe fine d’échantillon en paraffine. Le système STS […]
Le cryostat CM1950s un appareil dédié à la réalisation de cryosection d’échantillon en série.
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Les 2 cryostats CM3050s sont des appareils dédiés à la réalisation de cryosection d’échantillon en série.
Le four HybEZ est un four d’hybridation de paillasse simple. II est capable maintenir avec précision la stabilité de la […]
Microscope à lumière blanche avec caméra pour les analyses de coloration. Permet aussi l’analyse des échantillons avec une lumière polarisée.