

Plateforme: Cytométrie
À propos
La plateforme de cytométrie : expertise et fiabilité au service de la recherche
La plateforme de cytométrie a pour vocation de soutenir les chercheurs dans la mise en place d’expériences robustes et reproductibles. Elle constitue un espace de référence où savoir-faire technique et accompagnement scientifique se conjuguent pour garantir la qualité et la fiabilité des données.
Fondé en 1976 à la création du Centre d’Immunologie, le Service de Cytométrie fonctionne avec deux ingénieurs, Sylvain Bigot (responsable de service) et Laurence Borge. La responsabilité scientifique est assurée par Cyrille Mionnet. Le service est assisté d’un comité de pilotage, formé d’utilisateurs avancés, qui se réunit chaque mois.
Nos services s’articulent autour de quatre axes :
Développement de workflows de traitement et de préparation des données, intégrant contrôle qualité, compensation et normalisation, pour des analyses fiables quel que soit l’environnement logiciel.
Conception et optimisation de panels multiparamétriques, afin de produire des données exploitables dans des analyses conventionnelles comme multidimensionnelles.
Mise à disposition de protocoles validés, couvrant les étapes essentielles de la préparation des échantillons, du titrage des anticorps ou encore de l’étude de processus cellulaires clés tels que l’apoptose et le cycle cellulaire.
Standardisation et suivi des instruments, assurant la stabilité et la comparabilité des acquisitions dans le temps.
Les missions principales du service sont les suivantes :
- Tri cellulaire en conditions biologiques de tout type de cellules dans n’importe quel support: tube de 1,5ml à 15 ml ou plaques multi puits (96 ou 384 puits). Les tris sont effectués dans des conditions optimisant la viabilité cellulaire.
- Contrôle de qualité et maintenance des instruments.
- Formation des utilisateurs: les utilisateurs sont formés pour devenir autonomes sur l’ensemble des analyseurs du service. La formation se compose de deux modules, un module théorique et un module pratique sur un analyseur. L’utilisateur débutant est ensuite assisté au démarrage de ses propres expériences.
- Conseil et assistance pour les expériences de cytométrie, l’analyse de données et le tri cellulaire.
- Evaluation des nouvelles technologies d’analyse et tri cellulaire permettant de maintenir au meilleur niveau la cytométrie dans le service.
- Développement et optimisation des analyseurs et des trieurs : modification des instruments pour une détection optimale des sondes et protéines fluorescentes.
Le service dispose d’un agenda de réservation en ligne et d’un réseau de serveurs pour le stockage sécurisé des données.
Formation
Au-delà de ces services, la plateforme place la formation et l’accompagnement des utilisateurs au cœur de sa mission. Elle veille à transmettre et à faire appliquer les bonnes pratiques, garantissant ainsi rigueur méthodologique et reproductibilité des résultats. Des formations adaptée aux besoins et au niveau de cytométrie de chaque utilisateur sont proposées par la plateforme : Cytométrie conventionnelle multiparamétrique, cytométrie spectrale, tri cellulaire.
Open Science
Par cette approche, la plateforme contribue directement à l’excellence scientifique des projets de recherche et au renforcement de la qualité des données générées en cytométrie.
Projets
Project : DECITIP Les cellules dendritiques plasmacytoides (pDCs) excellent dans la production des interférons de type I et III (IFN), […]


Notre santé repose sur un équilibre délicat entre la défense immunitaire contre les agents pathogènes et la tolérance vis à […]


Project : CholControl You are what your mother ate Impact transgénérationnel des régimes maternels via la régulation de l’activité RORγt […]

Lymph nodes are formed in the embryo by Lymphoid Tissue Inducer (LTi) cells. LTi cells arise not from the yolk […]

Innate immune cells are essential partners of the central nervous system, supporting both homeostasis and repair. Within the brain, perivascular […]

Projet : TREATLIVMETS Les métastases hépatiques surviennent chez près de 50 % des patients atteints de cancer, en particulier dans […]

Projet : Treating Breast Cancer Le cancer du sein est le cancer le plus fréquemment diagnostiqué chez les femmes dans […]

Project : pDCComp Les individus infectés par des virus ou souffrant de maladies inflammatoires développent un ensemble de troubles comportementaux […]

Project : PLBIO 2024 Coordinateur: Thierry Walzer, CIRI, Lyon. Autre participant: Nathalie Bendriss-Vermare, CRCL, Lyon. Résumé: Les cellules Natural Killer […]

Project : ACLAMADABREC En partie via leur efficacité à activer les cellules natural killer (NK) et les lymphocyte T CD8 […]

Project : MITI Autres participants: Magali Richard, LIG, Grenoble; Lionel Spinelli, hub CB2M du CIML. Résumé: Ce projet vise à […]

Project : UNFIRE Autres participants: Ciphe (Ana Zarubica), Hospices Civils de Lyon et CIRI (Sophie Trouillet-Assant, Thierry Walzer), équipe CoVir […]





Project : PLBIO-25 Coordinateur: Marianne BURBAGE, Institut Curie, Paris. Autre participant: Andrew GRIFFITHS, ESPCI, Paris. L’efficacité des lymphocytes T CD8 […]

Project : DCFUNDEVSCREEN Résumé: Des études chez la souris ont montré le rôle clé antiviral/tumoral des cellules dendritiques, plasmacytoïdes (pDCs) […]

Project : RIPIREVI Autres participants: CIPHE (Ana Zarubica et collègues). Résumé: Les interférons de type I (IFN-Is) sont essentiels à […]


Project : LYMPHOMATLAS Des études multi-omiques en cellule unique dans les lymphomes B ont permis de mettre en lumière un […]


Project : NRegSkin Porteur: Mei LI (IGBMC, Strasbourg). Autres participants: Katia Boniface, Julien Seneschal (Université de Bordeaux). Résumé: La peau […]

La progression du lymphome folliculaire est marquée par des cycles iteratifs de rémission et de rechute, ces dernières résultant généralement de la […]

Project : ICARO Les vaccins acellulaires actuels sont surtout efficaces contre les pathogènes extracellulaires, mais échouent à induire une réponse […]


Project : PPTuft Ce projet coordonné par Philippe Jay (IGF, Montpellier) en partenariat avec notre équipe vise à déterminer le […]

Project : Myfunbat Le projet vise à définir la diversité et les fonctions des macrophages du tissu adipeux brun (BAT), […]

Project : Endopos Le projet EndoPos explore le rôle de l’enzyme GDPD2, produite notamment par les fibroblastes de la pulpe […]

Project : T-MAC Le projet T-MAC vise à comprendre comment les macrophages testiculaires et leurs niches contribuent au maintien de […]

Project : NICHE Le projet NICHE explore le concept selon lequel les macrophages (Mac) dépendent de niches locales formées par […]

Project : Path Finder Ce projet vise à caractériser le développement spatio-temporel des cellules dendritiques de type I (cDC1) dans […]

Project : DeCoDis In the context of a European consortium, we are investigating the dynamics and function of border-associated macrophages […]

Project : IMPACT Sensors Other participants : IGBMC, Strasbourg (Nicolas Charlet-Berguerand) and Institut Curie, Paris (Franck Perez). Duration 2025 – […]

Partner : University of Milan, Italy ( Prof. Angelo Poletti , DISFEB) Frameshift mutations in HSPB8 cause neuromyopathies by disrupting […]

CNRS – University of Melbourne Graduate Research Projects The project investigates the molecular interplay between the E3-ubiquitin ligase MARCH1 and […]

Bone marrow metabolic niches regulate hematopoiesis (MetaNiche, ANR-22-CE15-0015-02). Duration: 2023–2027 (42 months).Partners & funding amounts: Institut Curie (L. Perié), Institut […]

Full title & acronym: Biomarkers established to stratify sepsis long-term adverse effects to improve patients’ survivorship (BEATsep).Duration: 2024–2029 (60 months).Partners […]

Targeting intratumor metabolic heterogeneity in neuroblastoma to develop innovative treatments (IMAGINe) Type: National.Duration: 2024–2029 (48 months).Partners & funding amounts: CRCM […]

Targeting acute myeloid leukemia immunosuppressive microenvironment by combined IDO1 inhibition and PD-1 blockade Type: European.Duration: 2023–2027 (36 months).Partners & funding […]

South-Research On Cancer for Kids. INCA Pediacriex (France) Type: National (integrated cancer site).Full title & acronym: South-Research On Cancer for […]

La réponse de l’hôte aux pathogènes est orchestrée par le système immunitaire et le système nerveux, tous deux présents dans […]

Nous avons démontré que la neurokine TAFA4, produite par des neurones sensoriels de la peau, peut promouvoir la réparation tissulaire […]

Au delà des processus de perception de la douleur qui sont induits en cas de lésion ou d’infection de la […]

Duration: 2021–2025.Partners & funding amounts: APHM/La Timone (E. Tabouret); amount for team: 325 k€.Responsibilities: PI–coordinator (only beneficiary)Theme & content of […]

Anti-GD3 CAR-NK cells to overcome therapeutic resistance in glioblastoma (CARaïbes). Type: National.Duration: 2025–2029 (48 months).Partners & funding amounts: INP-APHM (E. […]

Le projet GCselection, coordonné par le Dr Pierre Milpied (CIML), revisite les mécanismes de maturation des anticorps dans les centres […]


Équipements
Trieur de cellule conventionnel 4 lasers, 17 couleurs
Trieur de cellule conventionnel 5 lasers, 18 couleurs
Cytomètre conventionnel 3 lasers, 8 couleurs
Cytomètre conventionnel 4 lasers, 16 couleurs
Cytomètre conventionnel 5 lasers, 18 couleurs
Cytomètre conventionnel 4 lasers, 18 couleurs
3 lasers Laboratoire P3 Fiancé par ITMO Cancer
Cytomètre spectral 5 lasers
Trieur de cellules conventionnel 3 lasers 9 couleurs en BSL3 Equipement financé par l’ITMO Cancer